寶可夢頭目
寶可夢傳說阿爾宙斯有著紅色發光的眼睛，體型較大的寶可夢稱為「頭目」。頭目和一般寶可夢基本上是一樣的，只是會用比較強的招式，還有體型較大。
捕捉到的寶可夢頭目，會在名字旁顯示紅色的頭目圖示，也會有較高的初始奮鬥等級。如下圖，烈焰猴頭目一抓來時，HP、特防、速度的奮鬥等級都已經 3 級。
捕獲寶可夢頭目的技巧
要直接丟球捕獲寶可夢頭目，銀河隊星級必需升到 5，不然星級 5 之前都會顯示紅色不可捕獲的狀態，只能進入戰鬥將牠打到殘血再丟球。
很多寶可夢頭目出現的地方都沒有遮避物，可使用煙彈來隱藏自己。
也可以丟食物給頭目吃，頭目在進食時，捕獲成功率會大增 (變成綠色)，再從背後丟超重球，就很容易捕獲成功。
黑曜原野的寶可夢頭目
| 寶可夢頭目 | 等級 | 出沒地點 |
|---|---|---|
| 泳圈鼬 | 31 | 角鹿山道 |
| 派拉斯特 | 30 | 角鹿高崗 |
| 驚角鹿 | 42 | 角鹿高崗 |
| 卡比獸 | 45 | 真砂平原 |
| 胡地 | 60 | 真砂平原 |
| 勒克貓 | 40 | 荒園開墾地 |
| 長耳兔 | 40 | 深幽森林 |
| 飛天螳螂 | 42 | 巨木戰場 |
| 音箱蟀 | 30 | 森林膳房 |
| 大尾狸 | 16 | 河口堤堰 |
| 烈焰馬 | 40 | 蹄鐵草原 |
| 赫拉克羅斯 | 45 | 險林 |
| 姆克鳥 | 42 | 馳風道 |
| 隆隆石 | 30 | 黑金隧道 |
| 暴鯉龍 | 40 | 心齊湖 |
| 烈焰猴 | 65 | 玫瑰島 |
| 幸福蛋 | 62 | 黑曜瀑布 |
| 鯉魚王 | 55 | 靠近黑金隧道的水邊 |
| 大嘴蝠 | 35 | 靠近黑金隧道 |
紅蓮濕地的寶可夢頭目
| 寶可夢頭目 | 等級 | 出沒地點 |
|---|---|---|
| 圈圈熊 | 41 | 熊的比武場 |
| 圈圈熊 | 55 | 大嘴沼澤 |
| 大岩蛇 | 50 | 隆隆坡 |
| 河馬獸 | 46 | 泥炭台地 |
| 鯰魚王 | 64 | 立志湖 |
| 帕奇利茲 | 40 | 大嘴沼澤 |
| 巨蔓藤 | 45 | 大嘴沼澤 |
| 尖牙籠 | 43 | 羊鬍草原 |
| 蜂女王 | 61 | 羊鬍草原 |
| 坦克臭鼬 | 36 | 緋紅沼 |
| 遠古巨蜓 | 58 | 羽音原野 |
| 黏美兒 | 50 | 試煉沙洲 |
| 土台龜 | 65 | 試煉沙洲 |
| 雷丘 | 52 | 金色平野 |
| 大舌舔 | 52 | 雲霧遺跡 |
| 獨角犀牛 | 45 | 靠近金剛後山 |
| 羅絲雷朵 | 50 | 雲海山道（日） |
| 烏鴉頭頭 | 55 | 雲海山道（夜） |
群青海岸的寶可夢頭目
| 寶可夢頭目 | 等級 | 出沒地點 |
|---|---|---|
| 龍王蠍 | 45 | 銀杏海灘 |
| 帝牙海狮 | 50 | 銀杏海灘 |
| 黑夜魔靈 | 65 | 鬼枯原 |
| 帝王拿波 | 69 | 望島灘 |
| 吉利蛋 | 51 | 沙洲道 |
| 霓虹鱼 | 60 | 海草樂園 |
| 海兔獸 | 61 | 海草樂園 |
| 九尾 | 61 | 吹火島 |
| 暴鯉龍 | 65 | 沙手 |
| 豪力 | 40 | 離散石灘 |
| 章魚桶 | 46 | 離散石灘 |
| 紳士蛾 | 56 | 隱泉之路 |
| 千針魚 | 55 | 望島灘 |
| 巨翅飛魚 | 50 | 寧靜灣 |
| 毒刺水母 | 50 | 大魚隱岩 |
| 哥達鴨 | 50 | 戲水潟湖 |
| 東施喵 | 45 | 帷幕海角 |
| 長尾怪手 | 50 | 後浦 |
天冠山麓的寶可夢頭目
| 寶可夢頭目 | 等級 | 出沒地點 |
|---|---|---|
| 大鋼蛇 | 60 | 神闔山道 |
| 皮可西 | 62 | 妖精之泉 |
| 黏美龍 | 70 | 古代採石場 |
| 大朝北鼻 | 73 | 迷幻洞窟 |
| 尖牙陸鯊 | 56 | 攀崖崖 |
| 倫琴貓 | 51 | 祈禱廣場 |
| 電擊魔獸 | 69 | 笠雲錐道 |
| 紳士蛾 | 55 | 迷失山林 |
| 天蠍 | 52 | 神闔寺院遺址 |
| 超甲狂犀 | 74 | 祈禱廣場 |
| 隆隆岩 | 60 | 隆隆山地 |
| 尖牙籠 | 52 | 靠近離泉 |
| 夢妖魔 | 61 | 列石山道 |
| 天蠍王 | 77 | 太古洞穴 |
| 叉字蝠 | 60 | 迷幻洞窟 |
純白凍土的寶可夢頭目
| 寶可夢頭目 | 等級 | 出沒地點 |
|---|---|---|
| 風鈴鈴 | 65 | 睿智湖 |
| 艾路雷朵 | 70 | 雪峰神殿 |
| 象牙豬 | 68 | 冰岩塊 |
| 暴雪王 | 68 | 冰岩塊 |
| 洗翠狃拉 | 61 | 冰岩塊 |
| 長毛豬 | 65 | 冰岩塊 |
| 小山豬 | 62 | 冰岩塊 |
| 沙奈朵 | 70 | 心形岩山 |
| 怪力 | 70 | 往戰場的路 |
| 冰鬼護 | 62 | 酷寒荒地 |
| 雪妖女 | 72 | 雪崩坡 |
| 烈咬陸鯊 | 85 | 雪崩坡 |
| 路卡利歐 | 70 | 冰鬼瀑 |
| 電擊獸 | 65 | 冰鬼瀑 |